NSUN3 (NOP2/Sun RNA metytransferase-familie medlem 3) er et gen som koder for en RNA metytransferase involvert i modifisering av mitokondrielle tRNAer. Denne modifikasjonen er viktig for riktig mitokondriell proteinsyntese og funksjon. Mutasjoner i NSUN3 har vært knyttet til mitokondrielle sykdommer.