Dysbioseindeksen er et mål som brukes for å vurdere graden av ubalanse i tarmens mikrobiom, og indikerer tilstedeværelsen og alvorlighetsgraden av dysbiose. Den kvantifiserer avvik i mikrobiell mangfold og sammensetning sammenlignet med en sunn referansepopulasjon. En høyere indeks tyder på større dysbiose, noe som kan være knyttet til helseproblemer som betennelse, fordøyelsesforstyrrelser eller metabolske tilstander.